Le patologie su base alimentare sono causate dall'assunzione di alimenti e/o da singoli nutrienti e possono essere classificate in: malattie cronico-metaboliche, mediate da alterazioni dell’assetto lipidico e ormonale, in particolare l’insulina; allergie, provocate dal rilascio IgE-dipendente dell’istamina; intolleranze, dovute alla mancanza o ridotta attività di alcuni enzimi digestivi o a una anomala reazione immunologica dell'individuo diversa dal rilascio di IgE; reazioni tossiche, causate dalla presenza nel cibo di sostanze che si sono formate per la non corretta produzione o conservazione dell’alimento.
L'Istituto Superiore di Sanità (ISS) svolge attività di ricerca traslazionale ed epidemiologica, valutazione del rischio, consulenza tecnico scientifica al Ministero della Salute e attività di controllo ufficiale, in collaborazione con le autorità competenti.