Il Servizio Tecnico-Scientifico Grandi Strumentazioni e Core Facilities (FAST) è l’infrastruttura tecnologica centralizzata dell’Istituto Superiore di Sanità (ISS).
Il FAST mette a disposizione della comunità scientifica, sia interna sia esterna all’ISS, strumentazioni avanzate ad elevato costo e ad alta specializzazione, integrando tecnologie all’avanguardia con competenze tecniche altamente qualificate.
Seguendo la sua missione istituzionale, il personale del Servizio si occupa di:
- gestire strumenti ad alto costo e uso trasversale;
- garantire accesso condiviso ai ricercatori (anche esterni);
- curare manutenzione e aggiornamento delle apparecchiature;
- fornire formazione tecnico-scientifica;
- sviluppare nuovi metodi e tecnologie;
- elaborare e analizzare i dati prodotti.
Il FAST promuove un miglioramento continuo delle professionalità e delle capacità tecnologiche dell'Istituto Superiore di Sanità contribuendo a mantenerne ed aumentarne la competitività nella ricerca biomedica avanzata e la funzione di riferimento scientifico per il Paese.
Le competenze multidisciplinari presenti nel FAST favoriscono lo svolgimento di attività di ricerca di eccellenza, in forma autonoma o in collaborazione, e la fornitura di servizi ad elevato contenuto scientifico e tecnologico (anche per l'utenza esterna specialistica: https://corefacilities.iss.it).
Tutto questo ha l’obiettivo di:
- evitare duplicazioni costose (uno strumento invece di tanti);
- aumentare la qualità e l’affidabilità della ricerca;
- favorire collaborazioni tra gruppi diversi;
- rendere disponibili tecnologie avanzate anche a chi non le possiede.
Le aree (core facilities) del FAST sono i laboratori condivisi che forniscono accesso a strumenti, tecnologie e competenze specialistiche e si occupano di:
- calcolo scientifico;
- citometria;
- risonanza paramagnetica elettronica;
- microscopia avanzata;
- risonanza magnetica per spettroscopia ed imaging;
- proteomica;
- sequenziamento genomico (NGS).
Aree Tecnico-Scientifiche
Il Servizio è articolato nelle seguenti 7 aree:
Calcolo Scientifico
“High Performance Computing” (HPC): sviluppo ed implementazione di algoritmi ad alto grado di parallelismo. Progettazione, messa a punto e gestione di metodi, strumenti e sistemi per il trattamento di flussi di dati generati da apparecchiature scientifiche in biomedicina e, in generale, da archivi e sorgenti digitali. Implementazione su architetture: multicore, multi CPU, multi GPU. Applicazioni e librerie di machine learning, intelligenza artificiale e reti bayesiane.
Dell'area fa parte un Servizio di Bioinformatica il cui obiettivo è quello di offrire supporto nell’analisi di dati high-throughput da diverse fonti: genomica (whole exon-sequencing), trascrittomica (RNA-seq, targeted-sequencing), epigenomica (ChIP-seq), proteomica.
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Referente: dott.ssa Irene Ruspantini
☎ +39 06 4990 3098
Citometria
L'Area di Citometria è equipaggiata con 4 analizzatori convenzionali che consentono analisi fino a 19 parametri di fluorescenza e, contemporaneamente, 2 parametri di scattering; un analizzatore spettrale dotato di 5 laser per l'analisi di tre parametri di scattering e fino a 64 parametri di fluorescenza; un cell sorter dotato di 4 laser, in grado di separare fino a 6 popolazioni cellulari sulla base di un massimo di 15 parametri di fluorescenza. Un'area dedicata per colture cellulari e preparazione dei campioni in condizioni di sterilità per le analisi citofluorimetriche.
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Referente: dott. Mario Picozza
☎ +39 06 4990 2550
Risonanza Paramagnetica Elettronica (EPR)
L'area di Risonanza Paramagnetica Elettronica (EPR) è dotata di 2 spettrometri a onda continua in banda X, e uno spettrometro in banda Q. L'EPR viene applicata, in vitro/ex vivo, allo studio di radicali liberi, stress ossidativo, antiossidanti, struttura e dinamica delle macromolecole, membrane, metalloproteine, struttura e proprietà dei materiali, danno da radiazione, includendo campi della ricerca pre-clinica (patologie degenerative e tumori).
L‘area si avvale anche di competenze e tecniche per la dosimetria delle radiazioni ionizzanti (luminescenza stimolata e altri rivelatori avanzati) e per lo studio di stress ossidativo.
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Referente: dott.ssa Cinzia De Angelis
☎ +39 06 4990 2248-2747
Microscopia
L'area è dotata di:
- due microscopi confocali a scansione laser per studi in fluorescenza di sistemi cellulari, organismi intatti e tessuti biologici;
- un sistema Zeiss LSM 900 per la tecnica di microscopia live-imaging;
- due microscopi elettronici a scansione ad alta risoluzione;
- un microscopio elettronico a trasmissione per l'analisi a livello ultrastrutturale di sistemi biologici;
- gli strumenti necessari alla preparativa dei campioni per la microscopia ottica ed elettronica sia a scansione che a trasmissione.
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Referenti:
dott.ssa Serena Cecchetti (Microscopia Confocale)
☎ +39 06 4990 2966
dott.ssa Lucia Bertuccini (Microscopia Elettronica)
☎ +39 06 4990 2092
Risonanza Magnetica per MRI e Spettroscopia in Alta Risoluzione
L'area è dotata di:
- uno spettrometro operante a 14,1 T in alta risoluzione per studi di metabolismo e di metabolomica in cellule, fluidi biologici e tessuti;
- un sistema RM per imaging e spettroscopia in vivo per piccoli animali operante a 7 T per studi di imaging morfologico, metabolico e funzionale.
L’area si avvale di competenze di ricerca pre-clinica in oncologia, neuroscienze, malattie dell’invecchiamento e metaboliche.
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Referenti:
dott.ssa Rossella Canese
☎ +39 06 4990 2567-3695
dott. Egidio Iorio
☎ +39 06 4990 2552-2124
Proteomica
L'area è costituita da due unità: spettrometria di massa (MS) e microarray a fase inversa (RPPA). La spettrometria di massa è applicabile a proteine semi-purificate per identificare e caratterizzare modifiche post-traduzionali e addotti, così come allo studio qualitativo e quantitativo di miscele complesse, proteomi sub-cellullari e totali, ricerca di biomarcatori e analisi di complessi proteici. L'unità si avvale, inoltre, di competenze nella preparazione di campioni biologici e analisi bioinformatica dei dati. L'analisi RPPA studia i livelli di attività di trasduzione del segnale. L'immunocolorazione, utilizzando più di 400 anticorpi validati, consente la misurazione semi-quantitativa automatizzata di un numero elevato di campioni.
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Referente: dott.ssa Serena Camerini
☎ +39 06 4990 3164
Next Generation Sequencing (NGS)
L’area NGS offre un servizio multipiattaforma con tecnologie di sequenziamento all’avanguardia (Ion Torrent, Illumina, 10X Genomics) a ricercatori dell'ISS e di istituzioni esterne.
I servizi erogati includono il sequenziamento microbico (SWGS, sia re-sequencing che de novo, 16S, ITS, RNAseq), sequenziamento mirato del DNA e dell’RNA basato sulla tecnologia Ampliseq (transcrittoma umano e murino, pannelli specifici), esoma, RNA totale, microRNA, LncRNA, amplicon sequencing, ChIP-seq.
Inoltre, l’area ha esperienza di trascrittomica a singola cellula e di trascrittomica spaziale.
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Referente: dott.ssa Manuela Marra
☎ +39 06 4990 3051
